להלן המחלות או הסיבוכים החשובים ביותר שעשויים לתרום כתוצאה מתסמונת קלינפלטר:
מומים מולדים, עיוותים וחריגות כרומוזומליות (Q00-Q99).
- חריגות מיקום של האשכים (אשכים).
מערכת הנשימה (J00-J99)
- ברונכיאקטאזיס (שם נרדף: bronchiectasis) - התרחבות צמודה או גלילית בלתי הפיכה מתמשכת של הסמפונות (דרכי אוויר בינוניות) העלולות להיות מולדות או נרכשות; תסמינים: שיעול כרוני עם "כריתת שומן בפה" (כיח משולש רב שכבתי: קצף, ריר ומוגלה), עייפות, ירידה במשקל וירידה בכושר התרגיל
- אמפיזמה ריאתי - היפר-אינפלציה בלתי הפיכה של המבנים הקטנים ביותר המלאים באוויר (alveoli, alveoli) של הריאות.
מחלות אנדוקריניות, תזונתיות ומטבוליות (E00-E90).
- השמנת יתר (השמנת יתר)
- סוכרת מסוג 2 (סוכרת)
- תסמונת מטבולית - שם קליני לשילוב הסימפטומים השמנה (עודף משקל), יתר לחץ דם (לחץ דם גבוה), גדל צום גלוקוז (דם בצום סוכר) ו אינסולין בצום רמות בסרום (עמידות לאינסולין) והפרעת מטבוליזם שומנים בדם (עלייה ב- VLDL טריגליצרידים, ירד HDL כולסטרול). יתר על כן, לעיתים קרובות ניתן להבחין בהפרעת קרישה (נטייה מוגברת לקרישה), עם סיכון מוגבר לטרומבואמבוליזם.
מערכת לב וכלי דם (I00-I99)
- ריאה תסחיף (חסימה של ריאתי עורק).
- טרומבואמבוליזם - יציאת קריש דם הסותם כלי בזרם הדם, מה שמוביל לבעיות במחזור הדם עם הרס רקמות
- דליות ורידים
מערכת השלד והשרירים ורקמת החיבור (M00-M99)
- אוסטאופניה (ירידה ב צפיפות עצם).
- אוסטאופורוזיס (אובדן עצם)
ניאופלזמות - מחלות גידולים (C00-D48)
- Extragonadal (מחוץ לבלוטת המין) גידולים של תאי נבט לא זורחים במדיאסטינום (שטח pleural באמצע, כלומר אנכית ריצה חלל רקמות בחלל בית החזה) [הופעה בין הגילאים 15 עד 30].
- קרצינומה של השד (סרטן השד) (סיכון מוגבר פי 50 → השתתפות בא ממוגרפיה הקרנה שימושית).
נפש - מערכת העצבים (F00-F99; G00-G99).
מערכת גניטורינארית (כליות, דרכי שתן - איברי רבייה) (N00-N99).
- דַדָנוּת (הגדלת בלוטות החלב).
פציעות, הרעלות ותוצאות מסוימות אחרות של גורמים חיצוניים (S00-T98).
- שבר של צוואר של עצם הירך (SHF, צוואר הירך שֶׁבֶר).