בחקלאות אורגנית, התנאים המיטביים של בעלי החיים באזורי ההאכלה והגידול תוך התמקדות ברווחתם הם העיקרון המנחה. חקלאות עם אוריינטציה בתעשייה אינה עומדת בקריטריונים לגידול ידידותי לבעלי חיים, מכיוון שהתשואות הרווחיות ולא החיה נמצאות בחזית.
בעלי חיים מוחזקים במרחבים מוגבלים עם מעט חופש תנועה, מה שמאלץ אותם לעמוד במערכות דיור רופפות. זה גורם לחץ כמו גם פציעות תכופות - שפשופים, חבורות, שבורות עצמות - לבעלי החיים. מאז פצעים אינם מתגלים או מטופלים עקב ההמונים, מערכת החיסון של בעלי החיים מוחלשת והם רגישים יותר למחלות כמו זיהומיות, מטבוליות, מחלות פולשניות ונגיעות טפילים. בנוסף, חיה בריאות מותקף על ידי פעילות גופנית לא מספקת, המתבטאת בצורה של היווצרות שרירים, גידים ועצמות מופחתים, מכיוון שרק עם פעילות גופנית מספקת יכול חילוף החומרים, תפוצה, ופעילות העיכול מתפקדת בצורה מיטבית. לבסוף, היעדר פעילות גופנית מביא לבשר באיכות ירודה מבעלי החיים, שאינו מכיל כמעט בשר שרירים אלא שומן רב.
מטפלים ברוב בעלי החיים המושווים בייצור בשר תעשייתי הורמונים ו אַנְטִיבִּיוֹטִיקָה, מכיוון שאוכלוסיית בעלי החיים הצפופה ברפת מגדילה את הסיכון למחלות להתפשט כמו מגיפה ולהוביל להפסדים כלכליים גבוהים. המוזרק “הורמונים"להגיע לרקמות הגוף דרך ה- דם ולהאיץ את משקל בעל החיים ואת עליית השרירים שלו. ה הורמונים מועברים לבני אדם באמצעות מזון מן החי - באמצעות בשר, מוצרי חלב ו ביצים - ויכול לגרום לתנודות הורמונליות בגוף האדם. הורמון המין הגברי טסטוסטרון זוהה בכמה מוצרים מן החי, אשר היו מעורבים בשינויים ביכולת הרבייה ובהתנהגות המינית בבני אדם. אַנְטִיבִּיוֹטִיקָה משמשים באופן שגרתי להגנה על בעלי חיים מפני זיהומים חיידקיים או לטיפול בהם באופן מונע כדי לקדם צמיחה.
כתוצאה מה מנהל of אַנְטִיבִּיוֹטִיקָה, בקטריה באורגניזמים מן החי והאדם מפתחים עמידות לאורך זמן, כלומר הם משתנים גנטית והופכים עמידים. זה הופך את הטיפול במחלות קשות כגון דלקת קרום המוח ואחר מחלות זיהומיות קשה יותר, מכיוון שמספר גדל והולך של חולים כבר לא מגיב לטיפולים אנטיביוטיים מצילי חיים ולכן אין אנטיביוטיקה מתאימה. כפי ש בקטריה הופכים עמידים יותר לאנטיביוטיקה שונים, קשה יותר לאנשי מקצוע בתחום הרפואה לטפל ביעילות במחלות חיידקיות קשות.
צורת האכלה של בעלי חיים תורמת לחסרים התזונתיים והחומר החיוני (מקרו ומיקרו-תזונתי) במזון שלנו. העגל החיוור ביותר שמגדלים וצרכנים רבים רואים בו רצוי מושג באמצעות האכלה חלב תחליף, שאינו מכיל ברזל. מגהץ הוא חומר חיוני חשוב (מיקרו-תזונה) עבור דם היווצרות. האכלה דלה בחומרים מזינים חיוניים הופכת את בעלי החיים לרגישים יותר למחלות ובתורם נותנת להם מינונים גבוהים של אנטיביוטיקה. כתוצאה מכך, העגל מגיע לצרכן עם מעט חומרים תזונתיים חיוניים ואיכות מספקת.
