העדפות מיניות מבוססות הן על נטייה גנטית והן על טביעות אפיגנטיות (גורמים סביבתיים שהם אינדיבידואלים לכולם). חשיבותן של השפעות סביבתיות בהתפתחות ההומוסקסואליות מאושרת על ידי מחקרים תאומים.
האחרונים הם מוקדמים במידה רבה ילדות טביעות בין הגילאים 0 עד 3 שנים.
קביעת המין הגנטי או הכרומוזומלי (XX או XO כמו גם XXX או XY או XXY וכן XYY) היא אובייקטיבית; עקב כך, בידול נקבה או בלוטת המין (או נקבה)השחלות/ שחלות או אשכים /אשכים) מתרחש בערך מהשבוע החמישי של הֵרָיוֹן.
זהות מגדרית (זהות מינית) בגרעין נוצרת גם במהלך השנה וחצי הראשונים לחיים.
בסוף השנה הרביעית לחיים מתחיל שלב ההבחנה המגדרית בפועל.
זהות מגדרית: "התחושה הסובייקטיבית של האדם לחוות את עצמו כזכר או נקבה / בינארי (או בין לבין / לא בינארי)" נוצרת ככל הנראה בעיקר מראש. מעט ידוע על התפתחותה נוספת של זהות מגדרית בגיל ההתבגרות, אם כי ניתן להניח שמרכיב חברתי גדול.
הפרעות בחילוף החומרים של הורמונים (ציר בלוטת יותרת המוח) ומשדרים עצביים (דופמין, סרוטונין) נחשבים גם לסיבות אפשריות.
