פרמטרים מעבדה מסדר ראשון - בדיקות מעבדה חובה.
- איתור RNA (RT-PCR * בסרום / משקאות חריפים) - בימים הראשונים של המחלה.
- IgM / IgG ספציפי לנגיף JE נוגדנים - מהשבוע השני למחלה.
* תגובת שרשרת טרנסקריפטאז-פולימראז הפוכה (RT-PCR) היא שילוב של שתי שיטות של ביולוגיה מולקולרית.
פרמטרים מעבדה מסדר שני - תלוי בתוצאות ההיסטוריה, בדיקה גופנית ופרמטרים חובה במעבדה - לבירור אבחנתי דיפרנציאלי.
- ספירת דם קטנה
- פרמטרים דלקתיים - CRP (C-reactive protein).
- גלוקוז בצום (סוכר בדם בצום)
