להלן המחלות או הסיבוכים החשובים ביותר העשויים להיות חולניים עם דלקת קרום המוח (MBE):
נפש - מערכת עצבים (F00-F99; G00-G99).
- לביליון רגשי
- בעיות ריכוז
- סובלנות מתח מופחתת
- הפרעות איזון
- תסמונת נוירסטנית עם נכות רגשית וירידה לחץ סוֹבלָנוּת.
- פרזיס (שיתוק)
עוד
- מַתְמִיד כְּאֵב (כולל עקב התכווצות של שלפוחית שתן ושרירי הלוע).
גורמים פרוגנוסטיים
- גיל מבוגר (> 60 שנים) - גורם סיכון עצמאי להתקדמות קשה.
- דיכוי חיסוני (דיכוי מערכת ההגנה של הגוף עצמו) - לחולים הסובלים מתרופות דיכאון יש סיכון גבוה יותר למצב שלילי עם תוצאה קטלנית (קטלנית).