אנדוקרינולוגים מטפלים בחולים עם התנאים הבאים, בין היתר:
- הפרעות בבלוטת התריס (כגון יתר פעילות בלוטת התריס או תת פעילות של בלוטת התריס)
- מחלת אדיסון (מחלה של קליפת יותרת הכליה)
- תסמונת קושינג
- הפרעות תפקודיות של בלוטות המין (שחלות, אשכים)
- סוכרת
- השמנת יתר (שמנת יתר)
- אוסטאופורוזיס
- הפרעות במטבוליזם של שומן (כגון עלייה ברמות הכולסטרול)
- גידולים שפירים וממאירים המייצרים הורמונים
שיטות בדיקה חשובות למחלות אנדוקרינולוגיות כוללות קביעת ריכוזי הורמונים בדם ובשתן וכן הליכי הדמיה כגון אולטרסאונד, טומוגרפיה ממוחשבת והדמיית תהודה מגנטית (MRI).