הסימפטומים והתלונות הבאים עשויים להצביע על אנמיה אפלסטית:
- נטייה מוגברת לדימום המתבטאת בהיווצרות מוגברת של המטומה (חבורות), דימום בחניכיים או הארכת מחזור הווסת
- עייף
- חולשה כללית
- קוצר נשימה
- צלצולים באזניים
- זיהומים (מתרחשים באופן כללי לעיתים רחוקות יותר כתסמין הראשון).