הפטולוגיה היא מומחיות של גסטרואנטרולוגיה. הוא עוסק באבחון וטיפול במחלות של הכבד ודרכי המרה עם כיס המרה והלבלב.
מחלות המטופלות על ידי הפטולוגים כוללות, למשל:
- זיהומים של הכבד (בעיקר זיהומים ויראליים כגון הפטיטיס, אך גם זיהומים חיידקיים ונגיעות בטפילים כגון דג כבד ואמבות)
- אבצסים בכבד
- מחלות כבד רעילות לאלכוהול או הנגרמות על ידי סמים
- צַהֶבֶת
- כבד שומני
- שחמת הכבד
- אי ספיקת כבד
- גידולים (כגון סרטן הכבד, גרורות בכבד, סרטן כיס המרה)
- דלקת בצינורות המרה
- אבני חן
- הפרעות בזרימת מרה
- מומים מולדים של הכבד
- כבד שומני חריף של הריון
