מחסור בחומצה אלפא-לינולנית גורם לירידה בהמרה ל- חומצה איקוסאפנטאנואית (EPA) וכן חומצה דוקוסאקסאנואית (DHA). לפיכך, עלולים להתרחש שינויים בהרכב קרומי התא וכן תגובות דלקתיות מוגברות. תסמיני המחסור הבאים עשויים להופיע: ליקוי ראייה, לקוי ריפוי פצע, עור ודלקת בקרקפת, הפרעות נוירולוגיות כגון דכאון, וחולשת שרירים.
