להלן המחלות או הסיבוכים החשובים ביותר שעשויים לתרום כתוצאה מכולנגיטיס חיידקי:
מחלות זיהומיות וטפיליות (A00-B99).
- אלח דם (דם הרעלה): כולנגיוספסיס (הרעלת דם נגרם על ידי כולנגיטיס חיידקית).
כבד, כיס מרה, ו מָרָה צינורות-לבלב (לבלב) (K70-K77; K80-K87).
- כיס המרה אמפימה (מוגלה הצטברות בתוך כיס המרה עקב דלקת).
- כבד מורסות (אוסף מכוסה של מוגלה ב כבד).
- שחמת המרה המשנית (מחלת כבד הקשורה לדלקת ופיברוזיס (ריבוי לא תקין של רקמת חיבור)).
- קפדנות (צמצום) של מָרָה תעלות.
- צלקות בצינורות המרה
נפש - מערכת עצבים (F00-F99; G00-G99)
- הפרעות במערכת העצבים המרכזית
מערכת גניטורינארית (כליות, דרכי שתן - איברי רבייה) (N00-N99).
- הפרעה בתפקוד הכליות