להלן המחלות או הסיבוכים החשובים ביותר שעשויים לתרום מזיהומי וירוס קוקסאקי:
מחלות אנדוקריניות, תזונתיות ומטבוליות (E00-E90).
- סוכרת מסוג 1
- בלוטת התריס (דלקת בבלוטת התריס)
עור ותת עורית (L00-L99)
- אוניכודיסטרופיה נרכשת (צמיחת ציפורניים פתולוגית) של שתי ציפורני הרגליים הגדולות עם אוניצ'ומדזה (ניתוק פרוקסימלי של צלחת הציפורן ממיטת הציפורן) ולוקוניכיה (כתמים לבנים על ציפורניים) משנית למחלת כף הרגל והפה הקשורה ל- Coxsackie A6. )
מערכת הלב וכלי הדם (I00-I99).
- דַלֶקֶת שְׁרִיר הַלֵב (דלקת של לֵב שְׁרִיר).
- דלקת קרום הלב (דלקת בקרום הלב)
נפש - מערכת עצבים (F00-F99; G00-G99)
- דַלֶקֶת קְרוֹם הַמוֹחַ (דַלֶקֶת קְרוֹם הַמוֹחַ).
- דלקת קרום המוח (מְשׁוּלָב דלקת במוח (דלקת קרום המוח) ו קרום (דלקת קרום המוח)).
- שיתוק
