להלן המחלות או הסיבוכים החשובים ביותר שיכולים להיגרם כתוצאה מדיסביוזה (חוסר איזון של פלורת המעיים):
מערכת הנשימה (J00-J99)
- נזלת אלרגית (נזלת אלרגית).
- אסתמה בסימפונות
- ברונכיטיס - דלקת בממברנה הרירית של הסמפונות.
- נזלת כרונית (נזלת)
- דלקת גרון (דלקת בגרון)
- דלקת אוזניים (דלקת באוזן התיכונה)
- סינוסיטיס (סינוסיטיס)
איברים יוצרי דם - מערכת החיסון (D50-D90)
- חסר חיסוני (חולשת הגנה) עקב חיידקי מעיים משפיעה על התפתחות ותפקוד הקשור למעי המערכת החיסונית.
מחלות אנדוקריניות, תזונתיות ומטבוליות (E00-E90).
- לקטוז חוסר סובלנות (אי סבילות ללקטוז).
עור ותת עורית (L00-L99)
- אקזמה אטופית (נוירודרמטיטיס)
- אורטיקריה (כוורות)
פֶּה, הוושט (הוושט), בטןומעיים (K00-K67; K90-K93).
- דלקת קיבה כרונית (דלקת בקיבה רירית).
- מחלת מעי דלקתית כרונית - קוליטיס כיבית, מחלת קרוהן.
- מיקוזיס מעיים (מחלה פטרייתית של המעי).
- שלשול (שלשול)
- דיברטיוליטיס - דלקת של בליטות (דיברטיקולה) של דופן המעי.
- דיברטיקולוזיס - בליטות של דופן המעי.
- דלקת המעי הגס (מחלה דלקתית של מעי דק).
- עצירות (עצירות)
- אנטרוקוליטיס נמקית (NEC) - מחלת מעי דלקתית הפוגעת במעי הגס הסופי (החלק האחרון של המעי הדק) או במעי הגס העולה ברוב המקרים; משפיע על 5-10 אחוזים מכל התינוקות שנולדו לפני 32 שבועות הריון או עם משקל לידה נמוך מ -1,500 גרם; שיעור ה- Gammaproteobacteria גדל, Negativicutes ו- Clostridia נמצאו במספרים קטנים
- reflux ושט (דלקת הוושט עקב ריפלוקס (lat. refluere = לזרום חזרה) של מיץ קיבה חומצי ותכולת קיבה אחרת אל הוושט (הוושט)).
- תסמונת המעי הרגיז (IBS) - הפרעת מעיים תפקודית בה לא ניתן למצוא הפרעות סיבתיות.
- כאבי כיב (כיב קיבה)
תסמינים וממצאים קליניים ומעבדתיים לא תקינים שאינם מסווגים במקומות אחרים (R00-R99).
- מטאוריזם (גזים)
נפש - מערכת עצבים (F00-F99; G00-G99)
- כְּאֵב רֹאשׁ תסמונות (למשל, מִיגרֶנָה).
עוד
- הפרעות במחסומי מעיים - נראה כי דיסביוזה הופכת את מחסום המעי לחלחל יותר.
- הפרעה בחילוף החומרים (קצב חילוף החומרים)
- עיכול תזונתי (למשל, עיכול של צמח פוליסכרידים; ייצור שרשרת קצרה חומצות שומן (SCFA) אצטט, פרופיונאט ובוטיראט).
- מרה מטבוליזם חומצי (המרה של ראשוני למשני חומצות מרה).
- הפחתת יעילות הטיפול בגידולים עם מעכבי ביקורת: הפחתה או אובדן של השפעת אנטי-גידול לאחר תרפיה עם אַנְטִיבִּיוֹטִיקָה; רמות גבוהות של מעיים "טובים" בקטריה (למשל, Bifidobacteria, Akkermansia ו- Ruminococcus) קשורים להשפעה טובה של מעכבי מחסום; חולים שקיבלו בעבר מגוון רחב אַנְטִיבִּיוֹטִיקָה מת תוך חודשיים ממוצע (לעומת 2 חודשים, בחולים שלא קיבלו אַנְטִיבִּיוֹטִיקָה בחודשים שקדמו להם): חולים עם טיפול אנטיביוטי קודם: יחס סיכון של 7.4; אנטיביוטיקה לאחר תחילת הטיפול במעכבי ביקורת: אין השפעה על הישרדות (יחס סיכון 0.9; 0.5 עד 1.4).